11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1917 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  853    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  27.63 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  26.84 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  26.02 
 
 
493 aa  60.1  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  24.38 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  39.68 
 
 
456 aa  50.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  27.92 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  25.21 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  29.57 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  25.25 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  22.17 
 
 
458 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>