34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1260 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  100 
 
 		 79 aa  159  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  46.15 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0603  sodium pump decarboxylase gamma subunit  36.59 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.477522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0638  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  30.67 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.471241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.47 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.47 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.47 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2481  oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  35.9 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  35.44 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  32.93 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3195  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  38.27 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.57 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3166  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  32.89 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  32.91 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2894  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  35.9 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11111  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  32.91 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0201  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.19 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.41736  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0802  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.39 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2987  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  32.89 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0970  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  32.89 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3069  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  35.06 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3337  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  38.16 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0893  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  37.88 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0062  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  29.87 
 
 		 82 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.2649800000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1320  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  36.84 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219843  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1029  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  35.37 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1219  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  33.78 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1125  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  29.21 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3267  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  29.21 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0150987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0063  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.79 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  35 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3616  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  41.43 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.384488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>