13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4394 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4394  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4880  hypothetical protein  85.43 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20330  hypothetical protein  46.94 
 
 		 82 aa  43.9  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322211  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  37.5 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  35.59 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20520  hypothetical protein  48.65 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3318  hypothetical protein  39.34 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.329513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  45.45 
 
 		 239 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7498  hypothetical protein  68 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  45.45 
 
 		 240 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3079  hypothetical protein  47.22 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.123584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  52.94 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  52.94 
 
 		 233 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>