13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3117 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3117    100 
 
 		 249 bp  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0779473  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0425    90.7 
 
 		 2179 bp  54  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.7 
 
 		 1092 bp  54  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1113 bp  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>