13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0597 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  52.86 
 
 		 305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  51.08 
 
 		 320 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  46.92 
 
 		 328 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  49.26 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  46.25 
 
 		 345 aa  249  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  46.95 
 
 		 305 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  47.89 
 
 		 353 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  47.67 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  40.76 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  45.21 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  30 
 
 		 951 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>