25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0332 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0332  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0399  hypothetical protein  93.79 
 
 		 184 aa  288  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4608  Protein of unknown function DUF2596  60.11 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5954  hypothetical protein  63.75 
 
 		 159 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6756  hypothetical protein  55 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0696  hypothetical protein  52.26 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0957  hypothetical protein  54.9 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4049  hypothetical protein  50.83 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0495  hypothetical protein  55.86 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02660  Protein of unknown function (DUF2596)  51.32 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2912  hypothetical protein  49.38 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8223  hypothetical protein  47.47 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0828  hypothetical protein  45.66 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0651  hypothetical protein  48.73 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0671  hypothetical protein  48.73 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758778  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0658  hypothetical protein  48.73 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0085  hypothetical protein  45.78 
 
 		 169 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0990  Protein of unknown function DUF2596  45.61 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4337  Protein of unknown function DUF2596  50.34 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10495  hypothetical protein  53.33 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4934  hypothetical protein  44.53 
 
 		 159 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0455  hypothetical protein  46.15 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6163  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0628  Protein of unknown function DUF2596  47.44 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03660  Protein of unknown function (DUF2596)  42.76 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.861967  normal  0.289484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>