15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3493 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3493  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  361  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  43.75 
 
 
335 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0634  hypothetical protein  35.43 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0534291  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.11 
 
 
185 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0999  hypothetical protein  30.9 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000710305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1284  hypothetical protein  34.81 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.016048  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  51.85 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0227  flavodoxin  30.97 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  22.63 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  22.63 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  22.63 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  38.6 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2355  flavodoxin  40.74 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0585  hypothetical protein  24.42 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0400292  decreased coverage  0.000284445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  29.17 
 
 
167 aa  41.2  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>