15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0227 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0227  flavodoxin  100 
 
 		 148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1597  flavodoxin  60.96 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  38.93 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0261  flavodoxin  38.3 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2355  flavodoxin  33.33 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2461  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00792569  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  31.46 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1173  flavodoxin  28.87 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  32.61 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3493  hypothetical protein  30.97 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  30.34 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1839  hypothetical protein  25.5 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  32.43 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  26.79 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  24.6 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>