14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2271 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2271  CRISPR-associated protein, APE2256 family  100 
 
 		 321 aa  645    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452676  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1342  CRISPR-associated protein APE2256 family  31.79 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.330295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1509  CRISPR-associated protein APE2256 family  27.8 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.113599  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1263  CRISPR-associated protein APE2256 family  27.78 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1109  CRISPR-associated protein APE2256 family  28.95 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000998852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1281  CRISPR-associated protein APE2256 family  27.82 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0224948 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5837  CRISPR-associated protein, APE2256 family  25.79 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0445  CRISPR-associated APE2256 family protein  29.37 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3373  hypothetical protein  26.24 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1479  APE2256 family CRISPR-associated protein  27.88 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0958  CRISPR-associated APE2256 family protein  27.16 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0258  CRISPR-associated APE2256 family protein  21.26 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1513  CRISPR-associated protein APE2256 family  23.7 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00403065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0745  CRISPR-associated protein APE2256 family  25.82 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>