16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3646 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3646  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  850    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1194  hypothetical protein  29.93 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1054  hypothetical protein  31.08 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2793  hypothetical protein  30.86 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3705  hypothetical protein  28.39 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5510  hypothetical protein  28.39 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2395  hypothetical protein  30.33 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2722  hypothetical protein  27.36 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000050933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3265  hypothetical protein  38.95 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2334  hypothetical protein  38.24 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3014  hypothetical protein  37.89 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1661  hypothetical protein  32.46 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3447  hypothetical protein  35.87 
 
 		 134 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1912  hypothetical protein  33.03 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0314  hypothetical protein  22.75 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0392  hypothetical protein  25.69 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.785789  normal  0.0103636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>