24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2751 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2751  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  184  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575251  normal  0.46355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1887  hypothetical protein  90.7 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.768995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1829  hypothetical protein  89.53 
 
 		 86 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00321962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1527  hypothetical protein  87.21 
 
 		 86 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.911126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1736  hypothetical protein  82.56 
 
 		 86 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1661  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0317359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2483  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00627198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1842  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1795  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1803  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2714  hypothetical protein  82.56 
 
 		 86 aa  156  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2309  hypothetical protein  81.4 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2499  hypothetical protein  80.23 
 
 		 86 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.514847  hitchhiker  0.00312336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2379  hypothetical protein  80.23 
 
 		 86 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1452  hypothetical protein  79.07 
 
 		 87 aa  150  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2320  hypothetical protein  74.42 
 
 		 98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.957769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1345  hypothetical protein  49.37 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3406  histidine kinase  50 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02804  hypothetical protein  44.16 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1018  hypothetical protein  39.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.473242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0066  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2065  hypothetical protein  32.91 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1090  hypothetical protein  32.91 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0569647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01550  hypothetical protein  32.89 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>