66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2587 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2587  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  66.67 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  37.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  48.94 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  51.06 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  44.23 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  51.11 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  47.62 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  48 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  37.1 
 
 		 319 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  47.5 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  57.14 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  47.06 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1247  protein of unknown function UPF0157  55.56 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  65.52 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  39.71 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  46.94 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  46.94 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  48 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  48.89 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  39.62 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  46.15 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  56.67 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  46.15 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  46 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  42.86 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  39.62 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  37.1 
 
 		 318 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  40.38 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  56.41 
 
 		 365 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  50 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  55.56 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  51.43 
 
 		 406 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  54.29 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  48.65 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  44.68 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  37.1 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  63.33 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  44.68 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  42.55 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  43.48 
 
 		 188 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  43.24 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  60 
 
 		 242 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  47.22 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  47.22 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  47.22 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  40.43 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  47.37 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  43.59 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  39.13 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  52.94 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  52.78 
 
 		 402 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  44.44 
 
 		 172 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>