122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2516 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  306  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2117  hypothetical protein  84.93 
 
 		 146 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0677538  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2441  hypothetical protein  79.45 
 
 		 146 aa  251  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2181  hypothetical protein  77.78 
 
 		 159 aa  245  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.02228  hitchhiker  0.000186068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1927  hypothetical protein  73.29 
 
 		 146 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000323397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2170  hypothetical protein  73.97 
 
 		 152 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1871  hypothetical protein  73.29 
 
 		 146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00350248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1898  hypothetical protein  73.29 
 
 		 146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000382294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1905  hypothetical protein  73.29 
 
 		 146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0367301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2421  hypothetical protein  73.29 
 
 		 146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029814  hitchhiker  0.00169444 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2247  hypothetical protein  73.97 
 
 		 152 aa  233  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100566  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1767  hypothetical protein  73.97 
 
 		 157 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000753323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2573  hypothetical protein  73.29 
 
 		 146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2379  hypothetical protein  72.6 
 
 		 152 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123307  normal  0.207331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1632  hypothetical protein  70.55 
 
 		 146 aa  225  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000957769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1740  hypothetical protein  65.52 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1074  hypothetical protein  55.32 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.056354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1007  hypothetical protein  54.23 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0431  hypothetical protein  52.52 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0576  hypothetical protein  54.01 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000050037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002897  hypothetical protein  53.96 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1950  hypothetical protein  51.08 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2010  hypothetical protein  51.08 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal  0.187397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1953  hypothetical protein  51.08 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0472193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1322  hypothetical protein  50.35 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1506  hypothetical protein  51.08 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03078  hypothetical protein  53.96 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01143  hypothetical protein  45.68 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2467  protein of unknown function UPF0153  49.65 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000723255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3515  hypothetical protein  47.85 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.529376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1667  hypothetical protein  49.65 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000235569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1281  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1325  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2444  hypothetical protein  49.65 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000434719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1968  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000843778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1943  hypothetical protein  49.64 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000318483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1336  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000903587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1024  hypothetical protein  47.22 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0895  hypothetical protein  47.92 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2006  hypothetical protein  50.36 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0150725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2239  hypothetical protein  48.92 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000027257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2394  hypothetical protein  50.36 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.245355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2117  hypothetical protein  50.36 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.707271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2003  hypothetical protein  49.64 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.808992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2368  hypothetical protein  48.25 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01156  hypothetical protein  48.94 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000316712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0887  protein of unknown function UPF0153  46.15 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01166  hypothetical protein  48.94 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000198247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2751  hypothetical protein  49.64 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361359  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1801  hypothetical protein  48.2 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.348768  normal  0.297133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2000  hypothetical protein  46.76 
 
 		 148 aa  149  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1955  hypothetical protein  48.59 
 
 		 169 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2819  hypothetical protein  50.74 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1358  hypothetical protein  47.18 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2070  hypothetical protein  52.85 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3505  hypothetical protein  48.59 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1151  hypothetical protein  48.25 
 
 		 213 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.706631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0721  protein of unknown function UPF0153  46.9 
 
 		 169 aa  146  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2409  hypothetical protein  45.89 
 
 		 206 aa  146  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1114  hypothetical protein  45.58 
 
 		 204 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95528  normal  0.301999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2074  hypothetical protein  48.59 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1340  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1324  hypothetical protein  47.89 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1327  hypothetical protein  54.55 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0898  hypothetical protein  47.89 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1661  protein of unknown function UPF0153  48.61 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1404  hypothetical protein  46.53 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0521  hypothetical protein  49.26 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1463  hypothetical protein  49.28 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2798  hypothetical protein  42.5 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0890  protein of unknown function UPF0153  46.85 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0929  hypothetical protein  46.85 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1626  hypothetical protein  45.83 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0937096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1608  hypothetical protein  47.22 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0865  protein of unknown function UPF0153  46.15 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1790  hypothetical protein  45.07 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0377386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2072  hypothetical protein  44.06 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0917  hypothetical protein  48.63 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2854  hypothetical protein  45.59 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4092  hypothetical protein  46.04 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47410  hypothetical protein  46.04 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0895733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1382  hypothetical protein  47.2 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1691  hypothetical protein  50.41 
 
 		 168 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3920  hypothetical protein  45.93 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0286797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32930  hypothetical protein  46.04 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0171  hypothetical protein  44.22 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000313306  normal  0.665672 
 
 
-
 
NC_004310  BR1477  hypothetical protein  49.59 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1776  hypothetical protein  45.32 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.924435  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1432  hypothetical protein  49.59 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2529  hypothetical protein  45.71 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1392  hypothetical protein  46.04 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0627  hypothetical protein  45.52 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3355  hypothetical protein  47.29 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3897  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1567  hypothetical protein  46.04 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4587  hypothetical protein  43.88 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3918  hypothetical protein  46.04 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.871403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0453  protein of unknown function UPF0153  43.36 
 
 		 170 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1068  protein of unknown function UPF0153  43.84 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0879  hypothetical protein  42.07 
 
 		 163 aa  129  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>