13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9225 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9225  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1011    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3471  hypothetical protein  50.2 
 
 
646 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.245401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0126  hypothetical protein  33.95 
 
 
352 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0192432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3396  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.86 
 
 
485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1097  hypothetical protein  29.53 
 
 
512 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5349  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.11 
 
 
348 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  0.183228 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4952  hypothetical protein  38.25 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7049  hypothetical protein  28.74 
 
 
1020 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0146  surface protein  28.5 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.99 
 
 
633 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4951  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.48 
 
 
238 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2886  putative small membrane protein  51.06 
 
 
79 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5232  hypothetical protein  30.6 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>