13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8248 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  45.14 
 
 		 409 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  43.79 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  43.54 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  42.57 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  41.4 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  39.08 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  41.96 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  38.87 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  39.3 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  40.54 
 
 		 353 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.09 
 
 		 951 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>