17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7280 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  46.81 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  48.61 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  37.91 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  52.05 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  53.03 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  48.72 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  42.73 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  37.68 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  38.82 
 
 		 166 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  40.32 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  40.58 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3386  rod shape-determining protein MreD  37.28 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.266152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  44.64 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  23.97 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  44.64 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1646  rod shape-determining protein MreD  27.43 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>