23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4280 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  480  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1066  aminoglycoside phosphotransferase  82.3 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1870  aminoglycoside phosphotransferase  73.55 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6068  aminoglycoside phosphotransferase  72.02 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3850  hypothetical protein  66 
 
 		 79 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.458129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 		 447 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11380  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 		 386 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  27.42 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2466  aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2755  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 		 401 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  28.49 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  28.72 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 426 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2721  aminoglycoside phosphotransferase  29.95 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.441003 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06463  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  29.52 
 
 		 318 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  26.06 
 
 		 316 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  26.06 
 
 		 316 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>