11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2703 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2703  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0453731  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1310  hypothetical protein  52.09 
 
 
382 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186399  normal  0.248493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  32.07 
 
 
409 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  24.4 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0693  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  30.52 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1944  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.53 
 
 
616 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4634  hypothetical protein  27.41 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  34.64 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4694  hypothetical protein  26.04 
 
 
351 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>