18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3197 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3197  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22660  hypothetical protein  37.89 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2581  hypothetical protein  36.46 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0282387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2362  hypothetical protein  25.84 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928893  normal  0.122175 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0490  hypothetical protein  28.04 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.665895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2908  hypothetical protein  36.26 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1384  hypothetical protein  23.58 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1382  hypothetical protein  25 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2799  hypothetical protein  31.65 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  33.82 
 
 		 380 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  33.77 
 
 		 766 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3617  hypothetical protein  32.5 
 
 		 117 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0737206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3555  hypothetical protein  36.36 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0363608 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0836  hypothetical protein  22.77 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.185102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 		 716 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  33.87 
 
 		 718 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 731 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  30.14 
 
 		 385 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>