14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1906 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  49.11 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  48.21 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  49.11 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  47.32 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  43.52 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3882  hypothetical protein  45.16 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0370234  normal  0.0307082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  35.51 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  36.79 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  37.62 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  38.18 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  37.11 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  29.89 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  32.76 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>