23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1758 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  81.25 
 
 
242 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  81.67 
 
 
242 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  81.25 
 
 
242 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  81.67 
 
 
242 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  83.33 
 
 
235 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  82.89 
 
 
235 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  83.33 
 
 
235 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  82.79 
 
 
237 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  67.38 
 
 
237 aa  318  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  67.98 
 
 
234 aa  317  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  66.23 
 
 
236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  64.02 
 
 
225 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  68.18 
 
 
233 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  58.69 
 
 
227 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  54.71 
 
 
236 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  40.29 
 
 
226 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  24.41 
 
 
234 aa  52  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  29.41 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  31.21 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  35 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>