20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2822 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2822  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1009    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1081  hypothetical protein  35.14 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1380  hypothetical protein  34.69 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.261772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1818  protein of unknown function DUF1176  32.95 
 
 		 349 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.272245  normal  0.067935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0654  hypothetical protein  32.8 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0292  hypothetical protein  30.9 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0885  protein of unknown function DUF1176  31.71 
 
 		 356 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1816  protein of unknown function DUF1176  30.25 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108675  normal  0.037174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1815  protein of unknown function DUF1176  25.21 
 
 		 356 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0690901  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3175  hypothetical protein  23.53 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2472  hypothetical protein  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3585  hypothetical protein  22.97 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0781  protein of unknown function DUF1176  22.51 
 
 		 361 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  29 
 
 		 138 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2744  hypothetical protein  23.73 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2612  hypothetical protein  23.45 
 
 		 347 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  24.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3831  hypothetical protein  21.68 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515019  normal  0.746263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  25.86 
 
 		 136 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>