17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1265 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1265  hypothetical protein  100 
 
 		 930 aa  1899    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3600  hypothetical protein  48.25 
 
 		 917 aa  848    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4443  hypothetical protein  50.22 
 
 		 946 aa  881    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0853  hypothetical protein  28 
 
 		 939 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.955255  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0725  hypothetical protein  27.95 
 
 		 943 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0693  hypothetical protein  27.74 
 
 		 943 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0979  hypothetical protein  27.28 
 
 		 943 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0988  hypothetical protein  28.24 
 
 		 939 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61990  hypothetical protein  27.2 
 
 		 948 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0499759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5393  hypothetical protein  27.2 
 
 		 948 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4492  hypothetical protein  27.65 
 
 		 943 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104208  normal  0.384908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4779  hypothetical protein  27.33 
 
 		 946 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0725  hypothetical protein  27.59 
 
 		 931 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234554  normal  0.0506019 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0956  hypothetical protein  27 
 
 		 1234 aa  48.5  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1224 aa  45.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2188  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1003 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1226 aa  44.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>