13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6299 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6299  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4840  hypothetical protein  35.84 
 
 
367 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  33.33 
 
 
381 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  30.7 
 
 
371 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  29.17 
 
 
357 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0385  hypothetical protein  30.23 
 
 
384 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  24.66 
 
 
395 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01680  hypothetical protein  26.14 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.607562  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  24.41 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0930  hypothetical protein  23.64 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0752  hypothetical protein  25.3 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.08 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5741  hypothetical protein  27.63 
 
 
403 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>