34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3980 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  49.76 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  47.37 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  46.08 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  43.2 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  42.79 
 
 		 207 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  39.05 
 
 		 210 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  43.65 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  41.24 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  38.86 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  38.21 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  43.32 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  42.64 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  38.16 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  43.2 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  43.2 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  43.69 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  45.09 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  39.9 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  39.9 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  42.13 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  37.04 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  35.81 
 
 		 240 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  38 
 
 		 209 aa  94.4  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  37.77 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.78 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  38.27 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  34.98 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  29.72 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  35.08 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  31.01 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  30.23 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  30.23 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>