16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3436 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  86.11 
 
 
184 aa  288  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  58.15 
 
 
184 aa  207  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  58.19 
 
 
191 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  57.3 
 
 
190 aa  201  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  53.51 
 
 
188 aa  198  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  55.06 
 
 
201 aa  191  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  51.91 
 
 
197 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  51.4 
 
 
182 aa  167  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  48.63 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  48.73 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  50.6 
 
 
186 aa  156  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  45.56 
 
 
185 aa  148  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  43.96 
 
 
205 aa  148  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  45.45 
 
 
191 aa  147  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  36.26 
 
 
119 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>