27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6210 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6210    100 
 
 		 263 bp  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    86.05 
 
 		 1992 bp  212  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  88.57 
 
 		 267 bp  210  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  88.57 
 
 		 267 bp  210  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  88.57 
 
 		 267 bp  210  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  88.57 
 
 		 267 bp  210  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  85.48 
 
 		 267 bp  147  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  83.96 
 
 		 267 bp  135  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  83.82 
 
 		 267 bp  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  83.82 
 
 		 267 bp  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  83.82 
 
 		 267 bp  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3887    80.54 
 
 		 261 bp  58  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  82.47 
 
 		 267 bp  58  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  82.47 
 
 		 261 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  82.47 
 
 		 261 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3868    80.54 
 
 		 261 bp  58  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  90.7 
 
 		 267 bp  54  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  90.7 
 
 		 267 bp  54  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  96.55 
 
 		 267 bp  50.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  96.55 
 
 		 267 bp  50.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 267 bp  50.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 267 bp  50.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 930 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 1128 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 930 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 930 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  84 
 
 		 288 bp  46.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.142788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>