36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5370 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  85.42 
 
 		 48 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  82.98 
 
 		 48 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  85.11 
 
 		 48 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  80.85 
 
 		 48 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  80.85 
 
 		 48 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  73.33 
 
 		 48 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  72.34 
 
 		 48 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  71.74 
 
 		 49 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  73.91 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  63.83 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  63.83 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  63.04 
 
 		 46 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  63.83 
 
 		 48 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  59.57 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  59.57 
 
 		 48 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  59.57 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  57.89 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  51.22 
 
 		 50 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  48.84 
 
 		 50 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  43.9 
 
 		 51 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2653  hypothetical protein  47.83 
 
 		 47 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  45.65 
 
 		 47 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  45.65 
 
 		 47 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  48.94 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1179  hypothetical protein  47.83 
 
 		 47 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  66.67 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0623  hypothetical protein  51.28 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.16233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0273  hypothetical protein  41.03 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0392259  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  51.22 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  51.22 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  35.42 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  43.18 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  35.42 
 
 		 50 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  35.42 
 
 		 50 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>