12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4416 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4416  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  285  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2332  hypothetical protein  64.19 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00672726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2637  hypothetical protein  60.96 
 
 		 163 aa  146  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.813016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1398  hypothetical protein  41.77 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1035  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0540  hypothetical protein  40.24 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00507326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0023  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0996823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2099  hypothetical protein  37.63 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0016  hypothetical protein  36.19 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.48826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3164  hypothetical protein  33.66 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147575  normal  0.188251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2828  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>