20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4269 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.67 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.29 
 
 		 270 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  53.51 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  53.38 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  53.23 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  53.23 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  53.61 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  53.23 
 
 		 276 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  52.03 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  51.49 
 
 		 276 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  50.56 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  51.49 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.64 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  46.64 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  46.47 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  49.81 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  50.38 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.08 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  34.8 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>