49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2277 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  54.4 
 
 		 942 aa  897    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 937 aa  1855    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  51.58 
 
 		 948 aa  891    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  44.64 
 
 		 940 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  51.25 
 
 		 957 aa  883    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  45.06 
 
 		 943 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  39.32 
 
 		 932 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  44.11 
 
 		 945 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  44.03 
 
 		 939 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  42.09 
 
 		 939 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  43.46 
 
 		 941 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  43.15 
 
 		 938 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  44.39 
 
 		 941 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  43.24 
 
 		 958 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  64.36 
 
 		 937 aa  1187    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  44.28 
 
 		 941 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  44.01 
 
 		 945 aa  658    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  44.97 
 
 		 939 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  61.82 
 
 		 942 aa  1124    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  64.79 
 
 		 937 aa  1191    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  51.73 
 
 		 949 aa  891    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  43.72 
 
 		 943 aa  632  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  43.85 
 
 		 937 aa  625  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  43.93 
 
 		 939 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  44.79 
 
 		 941 aa  611  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  41.5 
 
 		 921 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  41.18 
 
 		 925 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  41.14 
 
 		 925 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  39.68 
 
 		 914 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  38.4 
 
 		 929 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  38.75 
 
 		 924 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  38.16 
 
 		 927 aa  476  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  35.41 
 
 		 940 aa  425  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  32.47 
 
 		 892 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  40.03 
 
 		 919 aa  323  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  38.11 
 
 		 639 aa  290  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  49.8 
 
 		 279 aa  240  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  35.43 
 
 		 256 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  35.43 
 
 		 259 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  35.43 
 
 		 256 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  34.39 
 
 		 255 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  32.54 
 
 		 280 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  29.41 
 
 		 720 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  31.37 
 
 		 717 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  31.37 
 
 		 717 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  30.5 
 
 		 717 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.85 
 
 		 316 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  25.23 
 
 		 677 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  40.38 
 
 		 710 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>