13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1993 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1993  putative suppressor  100 
 
 		 630 aa  1283    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  55.66 
 
 		 624 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2994  Patatin  35.79 
 
 		 666 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3069  hypothetical protein  32 
 
 		 782 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  30.82 
 
 		 685 aa  214  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2024  patatin  31.93 
 
 		 631 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0531  hypothetical protein  33.19 
 
 		 605 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0560  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  33.41 
 
 		 605 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1013  hypothetical protein  35.56 
 
 		 782 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0563  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  32.9 
 
 		 605 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5875  Patatin  34.11 
 
 		 646 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  31.03 
 
 		 341 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  54 
 
 		 324 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>