More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1945 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  100 
 
 		 678 aa  1340    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  46.76 
 
 		 692 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  46.31 
 
 		 692 aa  621  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  48.45 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  47.45 
 
 		 703 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  46.17 
 
 		 691 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.69 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  47.29 
 
 		 699 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  47.12 
 
 		 692 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  48.9 
 
 		 695 aa  610  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  47.29 
 
 		 699 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  46.89 
 
 		 699 aa  605  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  47.2 
 
 		 692 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  46.77 
 
 		 698 aa  605  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.49 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  47.79 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  46.89 
 
 		 699 aa  606  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  47.57 
 
 		 692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  46.63 
 
 		 706 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.91 
 
 		 715 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  45.33 
 
 		 691 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  46.92 
 
 		 692 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  45.33 
 
 		 691 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  45.48 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  46.04 
 
 		 695 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  46.6 
 
 		 697 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  44.76 
 
 		 689 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  47.42 
 
 		 688 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  46.02 
 
 		 692 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  45.49 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  46.23 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  44.84 
 
 		 689 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  46.58 
 
 		 704 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  46.93 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  45.47 
 
 		 689 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  44.77 
 
 		 691 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  46.92 
 
 		 700 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  47.49 
 
 		 696 aa  593  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.58 
 
 		 689 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.28 
 
 		 700 aa  590  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  44.38 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  46.22 
 
 		 706 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  46.17 
 
 		 694 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.12 
 
 		 700 aa  591  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.12 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  43.72 
 
 		 697 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  44.44 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  46.76 
 
 		 697 aa  592  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  47.28 
 
 		 689 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  45.55 
 
 		 692 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  46.18 
 
 		 704 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  44.44 
 
 		 691 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.88 
 
 		 700 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  45.64 
 
 		 691 aa  588  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  45.75 
 
 		 697 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.72 
 
 		 697 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  46.68 
 
 		 690 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  45.91 
 
 		 691 aa  586  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  46.09 
 
 		 689 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  45.31 
 
 		 705 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  46.57 
 
 		 699 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.98 
 
 		 692 aa  587  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.9 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  44.82 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  44.96 
 
 		 692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  44.96 
 
 		 692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  45.2 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  44.82 
 
 		 694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  45.64 
 
 		 698 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  43.79 
 
 		 691 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  46.97 
 
 		 695 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  46.84 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  46.31 
 
 		 701 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  45.05 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  44.96 
 
 		 692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  45.45 
 
 		 700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  45.04 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  44.74 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  44.46 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  45.79 
 
 		 697 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  43.9 
 
 		 709 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  46.11 
 
 		 697 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  45.2 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  45.2 
 
 		 692 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  44.96 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  46.84 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  44.71 
 
 		 692 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  44.67 
 
 		 694 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  45 
 
 		 692 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  46.62 
 
 		 692 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  45.84 
 
 		 697 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  44.26 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  43.77 
 
 		 708 aa  579  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  44.15 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  45.35 
 
 		 693 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  45.31 
 
 		 704 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  44.64 
 
 		 698 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  45.6 
 
 		 700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  44.33 
 
 		 698 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  45.43 
 
 		 704 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>