24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7031 on replicon NC_013735
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013735  Slin_7031  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0855  hypothetical protein  61.54 
 
 
72 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1896  hypothetical protein  62.5 
 
 
70 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37242  hitchhiker  0.000312013 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6741  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.612072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3090  hypothetical protein  58.21 
 
 
68 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0112  hypothetical protein  62.12 
 
 
70 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0086  hypothetical protein  59.38 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3538  hypothetical protein  58.46 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0097  hypothetical protein  56.72 
 
 
71 aa  87  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0748733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1936  hypothetical protein  55.22 
 
 
71 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191302  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6791  hypothetical protein  55.22 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.79564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1753  hypothetical protein  58.46 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2323  hypothetical protein  57.81 
 
 
74 aa  84.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686412  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4795  hypothetical protein  55.71 
 
 
73 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2272  hypothetical protein  58.06 
 
 
73 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509938  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0293  hypothetical protein  61.9 
 
 
72 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00428454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1855  hypothetical protein  55.38 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3761  hypothetical protein  53.97 
 
 
74 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0323703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1093  hypothetical protein  56.25 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1092  hypothetical protein  56.06 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.487472  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3549  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00260919  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4596  hypothetical protein  47.14 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0159  hypothetical protein  43.75 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1590  hypothetical protein  31.25 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>