15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6227 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6227  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 420 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3988  protein of unknown function DUF218  32.22 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672563  normal  0.593684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1483  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  35.29 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  36.17 
 
 		 210 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  36.71 
 
 		 188 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  33.98 
 
 		 198 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  32.99 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  32.99 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  32.94 
 
 		 210 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  30.71 
 
 		 229 aa  43.5  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>