16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5160 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  100 
 
 
692 aa  1411    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  43.86 
 
 
705 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  34.07 
 
 
675 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  31.51 
 
 
685 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  28.95 
 
 
663 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  29.1 
 
 
669 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  26.61 
 
 
673 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  26.4 
 
 
687 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  26.06 
 
 
667 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  25.04 
 
 
686 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  24.89 
 
 
678 aa  144  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  26.47 
 
 
658 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  24.24 
 
 
656 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  23.54 
 
 
692 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  24 
 
 
668 aa  98.2  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  24.87 
 
 
262 aa  72  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>