23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4993 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  44.59 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  40.54 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  36.99 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  44.12 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  37.14 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  40.3 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  43.08 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  31.08 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  35.38 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  33.82 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  32.88 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  31.76 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  30.88 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  35.62 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  32.31 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  29.73 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>