15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4531 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4531  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  100 
 
 		 449 aa  910    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.851231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0311  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  62.92 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08511  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  55.16 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1329  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  49.55 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0669  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  48.42 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.405906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3871  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  43.81 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.209528  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1172  vitamin K-dependent gamma-carboxylase  37.26 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04035  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  33.26 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  27.66 
 
 		 332 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  27.66 
 
 		 332 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  27.66 
 
 		 332 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  23.53 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0154  HTTM domain protein  23.74 
 
 		 533 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  26.27 
 
 		 605 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  26.27 
 
 		 605 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>