28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0552 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  25.45 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1483  HTTM domain protein  22.54 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  24.4 
 
 
613 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  24.4 
 
 
613 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  29.49 
 
 
521 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  25.6 
 
 
602 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1602  HTTM domain protein  26.87 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2331  HTTM domain protein  30.63 
 
 
523 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.524598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4974  HTTM domain protein  22.98 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106846  normal  0.33114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  24.69 
 
 
605 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  24.69 
 
 
605 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0154  HTTM domain protein  22.18 
 
 
533 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0899  HTTM domain protein  29.17 
 
 
521 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4531  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  27.74 
 
 
449 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.851231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1276  HTTM domain protein  22.48 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2239  hypothetical protein  29.44 
 
 
529 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1197  hypothetical protein  27.8 
 
 
562 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2906  HTTM domain protein  31.66 
 
 
497 aa  52.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147684  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0621  HTTM domain protein  28.76 
 
 
538 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3264  HTTM domain protein  32.79 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4244  HTTM domain protein  29.73 
 
 
370 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2136  hypothetical protein  22.54 
 
 
636 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1979  hypothetical protein  28.18 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31770  hypothetical protein  30.58 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0669  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  20.64 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.405906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>