15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3492 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3492  Protein of unknown function DUF1059  100 
 
 		 57 aa  115  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2679  hypothetical protein  50.88 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0285865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4826  hypothetical protein  65.22 
 
 		 47 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3551  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1079  hypothetical protein  38.6 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132852  normal  0.282307 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0235  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3537  hypothetical protein  39.29 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.120714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4816  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5363  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5789  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5387  hypothetical protein  39.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5474  hypothetical protein  39.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387175  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4795  hypothetical protein  39.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0635  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04788  hypothetical protein  41.07 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0838812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>