17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2544 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1143    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146923  normal  0.0442965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5102  hypothetical protein  33.56 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.992702  normal  0.44393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4682  hypothetical protein  27.21 
 
 		 552 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2979  hypothetical protein  28.21 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2987  hypothetical protein  30.82 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1430  hypothetical protein  24.91 
 
 		 595 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916025  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1663  hypothetical protein  23.48 
 
 		 609 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3793  normal  0.940758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3783  hypothetical protein  33.16 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3865  hypothetical protein  30.37 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4985  hypothetical protein  22.18 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1674  hypothetical protein  23.71 
 
 		 603 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0284066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3657  hypothetical protein  22.36 
 
 		 361 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.402631  normal  0.0669891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0895  putative transmembrane protein  27.16 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3787  putative transmembrane protein  27.07 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513633  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0061  hypothetical protein  32.16 
 
 		 588 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0170  hypothetical protein  32.48 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.925369  normal  0.490181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>