15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2987 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2987  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1175    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5102  hypothetical protein  29.04 
 
 		 564 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.992702  normal  0.44393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4682  hypothetical protein  29.17 
 
 		 552 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2979  hypothetical protein  29.22 
 
 		 576 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2544  hypothetical protein  30.82 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146923  normal  0.0442965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4985  hypothetical protein  21.6 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2960  hypothetical protein  23.9 
 
 		 636 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1430  hypothetical protein  22.75 
 
 		 595 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916025  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3783  hypothetical protein  29.32 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1663  hypothetical protein  26.99 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3793  normal  0.940758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1674  hypothetical protein  24.31 
 
 		 603 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0284066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3865  hypothetical protein  24.43 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0198  hypothetical protein  22.62 
 
 		 649 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3657  hypothetical protein  26.92 
 
 		 361 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.402631  normal  0.0669891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3787  putative transmembrane protein  25 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513633  normal  0.514979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>