27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0193 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  62.14 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1270  hypothetical protein  47.73 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  49.51 
 
 
311 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1720  pentein-type domain-containing protein  46.15 
 
 
310 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0873915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05890  hypothetical protein  49.35 
 
 
309 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4680  hypothetical protein  42.48 
 
 
308 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1164  amidinotransferase family protein  42.02 
 
 
309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0253709 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3576  amidinotransferase  42.21 
 
 
354 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0346338  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3944  amidinotransferase  42.21 
 
 
336 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  40.45 
 
 
362 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3491  amidinotransferase  42.02 
 
 
333 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.736651  normal  0.0264598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5310  amidinotransferase  42.02 
 
 
346 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  41.16 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2543  amidinotransferase  41.37 
 
 
333 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  39.62 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00362  hypothetical protein  40.2 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117319  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001028  hypothetical protein  39.42 
 
 
333 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  41.86 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07112  hypothetical protein  38.76 
 
 
336 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2881  hypothetical protein  35.53 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2742  hypothetical protein  34.87 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31738  predicted protein  38.89 
 
 
302 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193058  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  22.87 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  23.39 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  25.77 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  24.12 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>