14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33320  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  290  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2221  TadE family protein  37.5 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.324888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0328  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4299  TadE-like  38.89 
 
 		 295 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  34.04 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3157  TadE family protein  44.16 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.254222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25260  TadE-like protein  37.7 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2772  hypothetical protein  43.61 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0125125  hitchhiker  0.0000106895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0367  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000168151  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18160  hypothetical protein  41.24 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  39.29 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26070  hypothetical protein  39.76 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  33.94 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0623  putative TadE-like family protein  51.26 
 
 		 125 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>