18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  54.05 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  50.8 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  57.49 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  52.41 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  54.55 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  51.31 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  52.15 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  51.9 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  44.86 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  48.37 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  45.45 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  49.36 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  51.97 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  44.85 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  31.11 
 
 		 119 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  35.37 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  27.67 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>