32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3892 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  99.17 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  60.74 
 
 		 247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  57.74 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  50.21 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.31 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  38.08 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  36.36 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  33.47 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.53 
 
 		 494 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  26.75 
 
 		 504 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  27.76 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  29.95 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  28.16 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  29.6 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.16 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  25.11 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.85 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.94 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  22.35 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.71 
 
 		 529 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0782  hypothetical protein  29.1 
 
 		 358 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  27.97 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  24.54 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  22.61 
 
 		 548 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  23.36 
 
 		 325 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  26.23 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  26.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  22.52 
 
 		 231 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>