25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2830 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  98.2 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  95.5 
 
 		 111 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  90.99 
 
 		 111 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  90.99 
 
 		 111 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  90.99 
 
 		 111 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  90.99 
 
 		 111 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  90.09 
 
 		 111 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  50.91 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  49.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  48.51 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  51.35 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  39.81 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  32.43 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  34.38 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  32.29 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  32.32 
 
 		 129 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  25 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  31.58 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  31.58 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>