29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2083 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2524  phytase, putative  82.95 
 
 
661 aa  1099    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2110  3-phytase  67.64 
 
 
690 aa  910    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0321159  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2083  3-phytase  100 
 
 
645 aa  1325    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829168  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1892  3-phytase  91.12 
 
 
653 aa  1216    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2208  phytase  88.51 
 
 
653 aa  1188    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04970  Phytase domain protein  37.08 
 
 
663 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3241  phytase domain protein  37.05 
 
 
640 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4063  3-phytase  34.41 
 
 
651 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3999  3-phytase  33.55 
 
 
692 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.739882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02401  putative phytase domain protein  29.41 
 
 
738 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2351  phytase  79.21 
 
 
101 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0531  3-phytase  35.26 
 
 
353 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258682  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2368  3-phytase  32.93 
 
 
345 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.95942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4238  3-phytase  35.36 
 
 
436 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4199  3-phytase  35.36 
 
 
436 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04140  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
736 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141129  normal  0.735382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  35.11 
 
 
1844 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5553  3-phytase  30 
 
 
424 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1644  3-phytase  30.33 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3124  3-phytase  30.43 
 
 
342 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5955  3-phytase  28.72 
 
 
418 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2879  phytase  25.94 
 
 
463 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172144  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2400  hypothetical protein  28.13 
 
 
340 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.830648  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4719  phytase  30.8 
 
 
358 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1367  phytase  26.15 
 
 
352 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1035  3-phytase  27.93 
 
 
350 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0101  phytase  25.46 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1122  phytase  24.78 
 
 
352 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1536  phytase  25 
 
 
356 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.4705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>