29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4063 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04970  Phytase domain protein  55.02 
 
 		 663 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3241  phytase domain protein  56.96 
 
 		 640 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4063  3-phytase  100 
 
 		 651 aa  1293    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3999  3-phytase  36.89 
 
 		 692 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2208  phytase  33.96 
 
 		 653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1892  3-phytase  34.49 
 
 		 653 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2524  phytase, putative  35.62 
 
 		 661 aa  310  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2083  3-phytase  33.72 
 
 		 645 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2110  3-phytase  44.44 
 
 		 690 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0321159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02401  putative phytase domain protein  44.18 
 
 		 738 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2368  3-phytase  41.96 
 
 		 345 aa  214  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.95942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0531  3-phytase  38.97 
 
 		 353 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4199  3-phytase  33.86 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4238  3-phytase  34.03 
 
 		 436 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408008 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04140  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 		 736 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141129  normal  0.735382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  31.73 
 
 		 1844 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1644  3-phytase  30.95 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3124  3-phytase  34.06 
 
 		 342 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5553  3-phytase  28.99 
 
 		 424 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5955  3-phytase  31 
 
 		 418 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2879  phytase  31.83 
 
 		 463 aa  117  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172144  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1122  phytase  31.89 
 
 		 352 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4719  phytase  30.65 
 
 		 358 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1035  3-phytase  29.48 
 
 		 350 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2400  hypothetical protein  28.66 
 
 		 340 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.830648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0101  phytase  33.59 
 
 		 352 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1367  phytase  27.33 
 
 		 352 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1536  phytase  29.87 
 
 		 356 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.4705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2351  phytase  47 
 
 		 101 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>