23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3865 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  91.94 
 
 
335 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  90.72 
 
 
345 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  90.72 
 
 
345 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  90.43 
 
 
345 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  96.23 
 
 
345 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  96.23 
 
 
345 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  100 
 
 
345 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  90.72 
 
 
345 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  86.67 
 
 
345 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  59.03 
 
 
349 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  40.64 
 
 
368 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1771  acyltransferase 3  36.06 
 
 
345 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1158  acyltransferase 3  33.52 
 
 
385 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00977171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  31.74 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2178  acyltransferase domain, membrane protein  26.06 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2797  acyltransferase 3  27.78 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  21.14 
 
 
347 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1380  hypothetical protein  26.65 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.786153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35600  hypothetical protein  29.88 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110812  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2999  hypothetical protein  29.5 
 
 
355 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1141  acyltransferase 3  23.69 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283735  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  22.38 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1110  acyltransferase family protein  30.61 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000203806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>